Les relations diplomatiques que l’Ordre souverain de Malte entretient avec 118 pays et avec l’Union européenne, son statut d’observateur permanent auprès des Nations Unies et les accords de coopération internationale conclus avec plus de 50 États, visent à faciliter ses activités humanitaires et à lui permettre un accès sans restriction et protégé, notamment dans les régions en crise.
Le réseau diplomatique de l’Ordre resserre ses relations avec les gouvernements des pays où il intervient. Ce réseau permet l’intégration de ses programmes médicaux aux systèmes de santé nationaux et régionaux et facilite l’importation de matériel médical afin qu’il parvienne aux populations dans le besoin le plus rapidement possible.
En juin 2008, le gouvernement du Canada a établi des relations officielles avec l'Ordre de Malte. Le ministre des Affaires étrangères a écrit au Grand Maître : « Le Canada tient l’Ordre de Malte en haute estime et apprécie son engagement caritatif et humanitaire de longue date.»
L'ambassadeur du Canada auprès du Saint-Siège est désigné représentant officiel du Canada auprès de l'Ordre de Malte. Le président de l’Association canadienne facilite le fonctionnement des relations officielles entre l’Ordre et le Canada.

L'Ordre de Malte a obtenu le statut d'observateur permanent auprès des Nations Unies en 1994.
En septembre 2024, Son Altesse Éminente Fra' John Dunlap est devenu le premier Grand Maître à se rendre au siège des Nations Unies à New York. Il a rencontré le Secrétaire général, António Guterres, et a prononcé un discours au Sommet des Nations Unies pour l'avenir.
L'ambassadeur Paul Beresford-Hill, Observateur permanent auprès des Nations Unies à New York, intervient régulièrement lors des réunions des Nations Unies. Le 26 août 2026, il est intervenu au Conseil de sécurité de l'ONU lors du débat public sur les crises alimentaires. Le 19 juin 2026, il s'est adressé au Conseil économique et social au sujet de Malteser International. Le 30 avril 2026, il s'est adressé au Conseil de sécurité au sujet de la situation au Moyen-Orient.
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